Razlozi E. coli se koriste za kloniranje gena

Mikroorganizam Escherichia coli ima dugu povijest u biotehnološkoj industriji i još je uvijek mikroorganizam izbora za većinu pokusa za kloniranje gena. Iako E coli je poznata općoj populaciji za infektivnu prirodu jednog određenog soja (0157: H7), malo je svjesno toga koliko je svestrano i naširoko koristi u istraživanju kao zajednički domaćin za rekombinantnu DNA.

01 Genetska jednostavnost

Bakterije korisne alate za genetsko istraživanje zbog relativno male veličine genoma u usporedbi s eukariotima. E coli stanice imaju samo oko 4.400 gena, dok je projekt ljudskog genoma utvrdio da ljudi sadrže oko 30.000 gena. Također, bakterije, uključujući E coli , žive cijeli svoj život u haploidnom stanju (imajući jedan skup nesparenih kromosoma). Kao rezultat toga, nema drugog skupa kromosoma koji prikrivaju učinke mutacija tijekom eksperimenta s proteinima.

02 Brzina rasta

Bakterije obično rastu mnogo brže od složenijih organizama. E coli raste brzo brzinom od jedne generacije na dvadeset minuta pod tipičnim uvjetima rasta. To omogućava pripremu kulture log-faze (srednjeg do maksimalne gustoće) preko noći i genetske eksperimentalne rezultate u samo nekoliko sati umjesto nekoliko dana, mjeseci ili godina. Brži rast također znači bolje stope proizvodnje kada se kulture upotrebljavaju u postupcima pojačane fermentacije.

03 Sigurnost

E coli prirodno se nalazi u crijevnim traktima ljudi i životinja gdje pomaže hranjivim tvarima (vitamini K i B12) domaćinu. Postoji mnogo različitih sojeva E coli koji mogu proizvesti toksine ili uzrokovati različite razine infekcije ako se proguta ili dopusti da napadne druge dijelove tijela. Unatoč lošem ugledu jednog posebno otrovnog soja (O157: H7), E coli općenito su relativno neškodljive kada se rukuje s razumnom higijenom.

04 Dobro sam proučavao

E coli genom je bio prvi koji je bio u potpunosti sekvencioniran (1997.). Kao rezultat, E coli je najvjerojatniji mikroorganizam. Napredno poznavanje mehanizama ekspresije proteina olakšava upotrebu u eksperimentima gdje je izražavanje stranih proteina i selekcija rekombinata ključno.

05 Strani hosting DNK

Većina tehnika genskog kloniranja razvijena je pomoću ove bakterije i još su uspješnija ili učinkovitija E coli nego u drugim mikroorganizmima. Kao rezultat toga, priprema kompetentnih stanica (stanice koje će zauzimati stranu DNK) nije komplicirano. Transformacije s drugim mikroorganizmima često su manje uspješne.

06 Jednostavnost njege

Budući da tako dobro raste u ljudskom crijevu, E. coli lako pronalazi gdje ljudi mogu raditi. Najviše je ugodno na tjelesnoj temperaturi. Dok 98,6 stupnjeva može biti malo toplo za većinu ljudi, lako je održavati tu temperaturu u laboratoriju. E. coli živi u ljudskom crijevu i drago je da konzumira bilo koju vrstu predigested hrane. Također može rasti i aerobno i anaerobno. Tako se može umnožiti u crijevu čovjeka ili životinje, ali je jednako sretan u petrijevoj posudi ili tikvici.

Kako E. Coli čini razliku

E. Coli je nevjerojatno svestran alat za genetske inženjere; kao rezultat, već je stvorio nevjerojatan raspon lijekova i tehnologija. Čak je, prema Popular Mechanics-u, postao prvi prototip za bio-računalo: "U modificiranom E. coli" transkriptoru ", kojeg su razvili istraživači Sveučilišta Stanford prošle ožujka, za DNA i enzime Potencijalno, to je korak prema izgradnji rabljenih računala unutar živih stanica koje bi se mogle programirati da kontroliraju ekspresiju gena u organizmu. " Takvo podvigstvo moglo bi se postići jedino korištenjem organizma koji je dobro razumljiv, jednostavan za rad i sposoban se brzo replicirati.