SiRNA koristi za molekularnu genetiku

siRNA, koja označava malu interferirajuću ribonukleinsku kiselinu, je klasa dvolančanih RNA molekula. Ponekad se zna kao kratka interferirajuća RNA ili silencirajuća RNA.

Prije ronjenja u ono što je točno siRNA, ne smije se miješati s miRNA, važno je znati funkciju RNA. Ribonukleinska kiselina (RNA) je nukleinska kiselina prisutna u svim živim stanicama i djeluje kao glasnik koji nosi upute od DNK za kontrolu sinteze proteina (Napomena: U nekim virusima RNA, a ne DNA, nosi i genetsku informaciju).

Mala interferirajuća RNA (siRNA) su male komadiće dvolančane (ds) RNA, obično oko 21 nukleotida duga, s 3 'izbočine (dva nukleotida) na svakom kraju koje se mogu koristiti za "interferirati" s prijevodom proteina vezanjem i promicanje razgradnje messenger RNA (mRNA) na specifičnim sekvencama.

Na taj način, siRNA sprečava proizvodnju specifičnih proteina baziranih na nukleotidnim sekvencama njihove odgovarajuće mRNA. Postupak se naziva RNA smetnja (RNAi), a također se može nazvati siRNA silencing ili siRNA knockdown.

Odakle dolaze

siRNA se općenito smatra da je došla iz duljih krajeva egzogenog uzgoja ili podrijetlom iz izvan organizma) RNA koja je preuzela stanica i prolazi daljnju obradu.

RNK često dolazi od vektora, poput virusa ili transpozona, te je otkriveno da imaju ulogu u antivirusnoj obrani, degradaciji pretjerano proizvedene mRNA ili mRNA za koju je prekinut prekinut i sprječavanje prekidanja genomske DNA transpozonima.

Svaki lanac siRNA ima 5 'fosfatnu skupinu i 3' hidroksilnu (OH) skupinu. Oni su proizvedeni od dsRNA ili oštrice petlje RNA koja nakon ulaska u stanice je podijeljen s RNase III poput enzima, pod nazivom Dicer, koristeći RNase ili restrikcijskim enzimima. SiRNA je zatim inkorporirana u multi-podjedinicni protein kompleks nazvan RNAi-inducirani silenizacijski kompleks (RISC).

RISC "traži" odgovarajuću ciljnu mRNA, gdje se siRNA zatim odmotava i, vjeruje se, antisense lanac usmjerava degradaciju komplementarnog lanca mRNA, koristeći kombinaciju endo- i eksonukleaznih enzima.

Medicinska i terapijska primjena

Kada se stanica sisavaca suoči s dvolančanim RNA, kao što je siRNA, može je pogriješiti kao virusni nusproizvod i inicirati imuni odgovor. Osim toga, uvođenje siRNA može uzrokovati nenamjerno izvan ciljanja gdje se i drugi neprikladni proteini mogu napasti i poništiti.

Predstavljanjem previše siRNA u tijelu može rezultirati nespecifičnim događajima zbog aktivacije urođenih imunoloških odgovora, ali s obzirom na sposobnost da tuku bilo koji gen od interesa, siRNA ima potencijal za mnoge terapijske svrhe.

Kemijski modificiraju siRNA kako bi poboljšali njihova terapijska svojstva kao što su:

• Poboljšana aktivnost
• Povećana stabilnost seruma i manja odstupanja
• Smanjena imunološka aktivacija

Mnoge bolesti mogu potencijalno biti tretirane inhibicijom ekspresije gena. Stoga je dizajn sintezne siRNA za terapeutsku uporabu postao popularan cilj mnogih biofarmaceutskih tvrtki.

Detaljna baza podataka o svim takvim kemijskim modifikacijama ručno je obrađena na siRNAmod, ručno obrađenu bazu eksperimentalno validiranih kemijski modificiranih siRNA.

izvori:

Tsai, C. S. Biomacromolecules: Uvod u strukturu, funkciju i informatiku. Wiley-Liss, 2007.

Whitehead, K. A .; Dahlman, J.E .; Langer, R. S .; Anderson, D.G. (2011). "Silencing ili stimulacija? Dostava SiRNA i imunološki sustav". Godišnji pregled kemijskog i biomolekularnog inženjerstva 2: 77–96.

Alekseev OM, Richardson RT, Alekseev O, O'Rand MG (2009). "Analiza profila ekspresije gena u HeLa stanicama kao odgovor na pretjeranu ekspresiju ili siRNA-posredovano iscrpljivanje NASP-a". Reproduktivna biologija i endokrinologija: 45.